这是一个精灵宝可梦与人类共存的大航海时代，海上贸易高度发达，大量手持强大宝可梦的训练家前往新航路成为海盗。穿越而来的余小顾获得外挂“海盗法典”，可以通过逮捕、审判海贼获得各种奖励。“审判海贼王振，提取并强化王振所有技能精灵之眼。”“审判海贼甘江，奖励培育宝可梦大钳蟹所用能量方块的制作方法。”“审判海贼肖林辉，奖励技能泡沫光线的训练方法……”……